Yüzdeki kırışıklıkları yok etme amacı ile ‘botulinum toksini’(botoks) yaptıran migrenli hastaların baş ağrılarının azaldığının fark edilmesi, migren tedavisinde botoks kullanımının yolunu açtı. Yapılan araştırmalar 3 aydan fazla bir süre boyunca, ayda 15 ya da daha fazla gün, migren karakterinde baş ağrısı olarak tanımlanan kronik migren tedavisinde botoks uygulamasının etkili olduğu gösterdi.

Kronik migreni olan hastalar sürekli ve aşırı miktarda ağrı kesici kullanmanın riskleri yanı sıra ağrı ile yaşamanın yarattığı olumsuz psikolojik durum ile baş başadır. Bilimsel veriler ışığında, botoks, kronik migrenin koruyucu tedavisinde yeni bir seçenektir. Kronik migrende botulinum toksin enjeksiyonu (botoks) uygulaması koruyucu bir tedavi seçeneği olarak FDA tarafından onaylanmış ; kullanım onayı da Sağlık bakanlığı tarafından Temmuz 2011 tarihinde verilmiştir. Uygulama için nöroloji uzmanının onay vermesi önermlidir. İnce iğnelerle hastanın alın , şakak arkası bölgeleri ,boyun ve trapez bölgelerine yapılan işlemin süresi yaklaşık 15-20 dk olup tek seanstır,etkisi bir hafta içinde başlar ve etkisi 3 ile 6 ay arasında devam eder. Ağrılar sıklaştıkça ideali en az 6 ay sonra uygulamayı tekrarlamaktır.